亦莊地區(qū)原屬南海子皇家苑囿的一部分，清末逐漸形成村落。
民國二年（1913年），亦莊地區(qū)屬直隸省冀州（今河北省）大興縣。
1953年6月，鹿圈鄉(xiāng)成立。
1958年6月，鹿圈鄉(xiāng)并入南郊農(nóng)場。
1963年年初，朝陽區(qū)十八里店公社的大羊坊南北村、小羊坊、康村4個村隊劃入紅星公社亦莊大隊。
1983年10月，紅星人民公社撤銷。
1984年5月，亦莊鄉(xiāng)成立。
2000年3月，亦莊、鹿圈2鄉(xiāng)合并為亦莊鎮(zhèn)。
2005年6月，設亦莊地區(qū)辦事處，與亦莊鎮(zhèn)實行“一套人馬，兩塊牌子”。