1949年12月設(shè)苗庵鄉(xiāng)屬大店區(qū)。
1954年11月屬蒿溝區(qū)。
1955年12月重歸大店區(qū)。
1958年9月,劃歸草寺公社,苗庵為大隊(duì)。
1961年3月建苗庵公社。
1966年9月草寺公社并入苗庵公社。
1969年2月,原時(shí)村區(qū)所轄李圩公社和蒿溝公社東部地區(qū)劃歸苗庵公社。
1980年1月,設(shè)苗庵區(qū),下設(shè)苗庵、李圩、王集、石橋、孫瓦房5個(gè)公社。
1984年5月,各公社更名為鄉(xiāng)。
1992年2月撤區(qū)并鄉(xiāng),孫瓦房劃歸蒿溝鄉(xiāng),苗庵、李圩、王集、石橋4個(gè)鄉(xiāng)合并為苗庵鄉(xiāng)。
2021年11月撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)改為苗庵鎮(zhèn)。