先秦時(shí)期,分屬胡子國(guó)、州來國(guó)地、后屬楚地;秦,分屬汝陰、下蔡縣地;漢,析置城父、山?h;南北朝時(shí)期,南宋將城父縣并入浚儀、北魏于山?h地置渦陽縣;隋,復(fù)置城父、山?h;唐天寶元年(742)改山?h為蒙城縣;明洪武中,城父縣入亳州,下蔡縣入壽州;清雍正十一年(1733),置鳳臺(tái)縣。
雍正十三年(1735),置阜陽縣。
同治三年(1864),置渦陽縣;民國(guó),依清制;1964年10月31日,從阜陽、渦陽、蒙城、鳳臺(tái)四縣劃出部分地區(qū)設(shè)置利辛縣。
1965年5月1日,組建利辛縣人民委員會(huì),析阜陽縣王人、王市、馬店、胡集4區(qū),析渦陽縣閻集、江集、張村3區(qū),析鳳臺(tái)縣闞疃、展溝2區(qū),析蒙城縣望疃區(qū),共10個(gè)區(qū)組成利辛縣轄區(qū)。
1969年撤銷10個(gè)區(qū)和54個(gè)公社,設(shè)20個(gè)大公社。
1975年設(shè)區(qū)劃社,置12個(gè)區(qū)、51個(gè)公社。
1981年成立利辛縣人民政府。
1983年政社分開,恢復(fù)鄉(xiāng)、村建制,58個(gè)公社全部改稱鄉(xiāng),設(shè)立鄉(xiāng)人民政府。
1985年廢柳東鄉(xiāng),置張村鎮(zhèn),隸屬張村區(qū),廢闞疃鄉(xiāng),置闞疃鎮(zhèn),隸屬闞疃區(qū),廢西潘樓鄉(xiāng),置西潘樓鎮(zhèn),隸屬西潘樓區(qū)。
1992年撤區(qū)并鄉(xiāng),轄19鎮(zhèn)、7鄉(xiāng)。
2000年,成立亳州地級(jí)市,利辛劃歸亳州市管轄。
至2020年,利辛縣下轄20個(gè)鎮(zhèn)、3個(gè)鄉(xiāng)。