解放前屬合肥南區(qū)曉星鄉(xiāng)。
解放后1955年成立高級社，南斗屬煙墩施河鄉(xiāng)。
1956年南斗屬曉星合作社、1958年成立合巢人民公社，南斗大隊屬曉星管理區(qū)。
1961年曉星管理區(qū)劃分為大圩、曉星兩個人民公社，南斗村屬曉星人民公社。
1966年文革開始，南斗大隊改名為年豐大隊。
1968年大圩、曉星兩鄉(xiāng)合并成立東方紅人民公社，南斗村屬東方紅公社。
1972年東方紅公社又分為大圩曉星兩社，南斗村屬曉星人民公社。
1978年合肥市去規(guī)劃調(diào)整，曉星公社劃為合肥市郊區(qū)，南斗屬合肥市郊區(qū)曉星公社。
1983年社改鄉(xiāng)，南斗大隊改為南斗村民委員會。
1992年，大圩、曉星兩鄉(xiāng)再次合并成立大圩鄉(xiāng)。
2007年鄉(xiāng)改鎮(zhèn)，南斗村名一直沿用至今。